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Commit e89123d

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Daniel Incicau
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1 parent d21c4d6 commit e89123d

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‎Clustering.yaml

Lines changed: 66 additions & 68 deletions
Original file line numberDiff line numberDiff line change
@@ -33,15 +33,13 @@ metric_collectors:
3333
name: "Biologically-relevant performance metrics gathering and postprocessing."
3434
software_environment: "R"
3535
repository:
36-
url: https://github.com/omnibenchmark-example/metric-collector.git
37-
commit: 458ab11
36+
url: https://github.com/imallona/clustering_report.git
37+
commit: 73e8e49
3838
inputs:
3939
- metrics.scores
4040
outputs:
41-
- id: biometrics.report.html
42-
path: "{input}/{name}/biometrics_report.html"
43-
- id: biometrics.tsv
44-
path: "{input}/{name}/biometrics.tsv"
41+
- id: report.html
42+
path: "{input}/{name}/plotting_report.html"
4543
stages:
4644

4745
## clustbench data ##########################################################
@@ -55,68 +53,68 @@ stages:
5553
url: https://github.com/imallona/clustbench_data
5654
commit: 366c5a2
5755
parameters: # comments depict the possible cardinalities and the number of curated labelsets
58-
- values: ["--dataset_generator", "fcps", "--dataset_name", "atom"] # 2 1
59-
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60-
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61-
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62-
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63-
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64-
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65-
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66-
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67-
- values: ["--dataset_generator", "graves", "--dataset_name", "dense"] # 2 1
68-
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69-
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70-
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71-
- values: ["--dataset_generator", "graves", "--dataset_name", "ring"] # 2 1
72-
- values: ["--dataset_generator", "graves", "--dataset_name", "ring_noisy"] # 2 1
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75-
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77-
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